Моделирование пространственной структуры N-концевого фрагмента α-амилазы Leptinotarsa decemlineata

Вернуться к списку статей
Доклады Башкирского университета. 2019. Том 4. № 1. С. 39-42.

Авторы

Цветков В. О.*
Башкирский государственный университет
Россия, Республика Башкортостан, 450076 г. Уфа, улица Заки Валиди, 32
Груденко Р. П.
Башкирский государственный университет
Россия, Республика Башкортостан, 450076 г. Уфа, улица Заки Валиди, 32

Абстракт

Методом моделирования по гомологии получена пространственная структура фрагмента α-амилазы колорадского жука. Амилазы колорадского жука и мучного хрущака имеют сходную конформацию активного центра и существенные различия физико-химических свойств образующих его аминокислотных остатков.

Ключевые слова

  • структура белка
  • моделирование по гомологии
  • колорадский жук
  • амилаза

Литература

  1. Абдуллатыпов А. В., Цыганков А. А. Моделирование пространственной структуры гидрогеназы HydSL пурпурной серной бактерии Thiocapsa roseopersicina BBS // Компьютерные исследования и моделирование. 2013. Т. 5. №4. С. 737-747.
  2. Зарубина С. А., Упоров И. В., Федорчук Е. А., Федорчук В. В., Скляренко А. В., Яроцкий С. В., Тишков В. И. Моделирование трехмерной структуры гидролазы эфиров альфа-аминокислот из Xanthomonas rubrilineans // Acta Naturae. 2013. Т. 5. №4(19). С. 68-77.
  3. Daniel B. Roche, Maria T. Buenavista, Stuart J. Tetchner, Liam J. McGuffin. The IntFOLD server: an integrated web resource for protein fold recognition, 3D model quality assessment, intrinsic disorder prediction, domain prediction and ligand binding site prediction // Nucleic Acids Research. 2011. V. 39. No. suppl_2. P. W171-W176.

Modeling the spatial structure of the N-terminal fragment of Leptinotarsa decemlineata α-amylase

Authors

Tsvetkov V. O.*
Bashkir State University
32 Zaki Validi Street, 450076 Ufa, Republic of Bashkortostan, Russia
Grudenko R. P.
Bashkir State University
32 Zaki Validi Street, 450076 Ufa, Republic of Bashkortostan, Russia

Abstract

The spatial structure of the Colorado potato beetle α-amylase fragment was obtained by homology modeling. Amylase of Colorado potato beetle and flour castaneum have similar conformation of the active site and essential differences of physico-chemical properties of its constituent amino acid residues.

Keywords

  • protein structure
  • homology modeling
  • Colorado potato beetle
  • amylase
Вернуться к списку статей